菱花集团有限公司位于济宁高新技术开发区，创建于1979年，在一个倒闭的镇办缫丝厂的基础上改建而成了济宁市柳行淀粉厂。当年 10月试车成功，1980年正式投产，成为山东省第二家、鲁西南第一家淀粉生产厂。当时，企业资产仅有贷款的8万元，职工30人，年产薯类淀粉800吨。当年就实现利税8万元。80年代初期，淀粉厂抓住国家对乡镇企业实行优惠政策、放水养鱼的机遇，加大投入、扩大规模，加大积累、滚动发展。到1987年，淀粉产量达到1万吨，产值过1000万元，利税达100万元。
1990年，固定资产已达到1425万元，销售收入为2679万元，利税总额达到352万元。1991年一跃成为济宁市第一家利税过千万的大型乡镇企业。
　　1991年上马市场终端产品——"菱花"牌味精。
　　1992年春，企业更名为 "济宁味精厂"，同年，"菱花"牌味精荣获智利国际博览会金奖。
　　1994年初成立 “山东菱花集团总公司”。1995年初成立 “菱花集团公司”，被国家经贸委确定为国家大型企业集团，成为山东省首个国家级乡镇企业集团。
　　实施资本运营战略:1993年，济宁味精厂就开始了资本运营、扩大规模的尝试。先后兼并了镇办企业南营淀粉厂、柳行草酸厂、柳行面粉厂等，通过改组、改造，盘活资本 300多万元。自1994年开始，菱花集团以拥有的人才、名牌和市场等无形资产投入，在全国范围内大跨度地进行资产重组。先后租赁了国营鄄城味精厂;以无形资产为投入，控股51%，联合了国有中型企业天津味精厂;以238万元购买了己破产的济宁第二化肥厂;1996年，相继以无形资产投入，以控股的形式，成功联合了长春味精厂、呼和浩特市糖厂和镇江味精厂三个国有中型企业;购买了破产的莱州味精厂全部资产。采用资本经营方式，只投资了 2600万元就盘活了3亿多元的国有存量资产;解决了3800余名下岗职工再就业的问题，取得了明显的社会效益。
菱花集团的发展经验以及资本运营经验引起了全国企业界、新闻界、学术界以及中央省市领导的广泛关注。1997年7月16日中央电视台经济半小时以“菱花冲击波”为题进行了专题报道，1997年8月28日人民日报经济部在人民大会堂举办了“菱花现象与资本运营高级研讨会”。
　　1997年，公司提出了"一个中心，两个基本点"，即以利润为中心，质量提高到最高点，成本降低到最低点的管理模式。市场经济的规律已证实:企业的利润来源于高质量、低成本;企业的竞争力取决于高质量、低成本;企业的信誉、品牌的含金量也取决于高质量、低成本。通过实施运作，当年大见成效。全年实现销售收入97374万元，利税10583万元，利润6541万元。
2000年，是新旧世纪交替的一年，是菱花集团承前启后、继往开来、二次创业的一年，也是企业由任城区划转济宁高新技术开发区的一年。在优越的发展环境下，公司总结了历年的管理经验，推行了优化运行管理，形成了以决策管理为中心，以供应、生产、销售、财务为关键环节的优化运行管理体系。通过实行优化运行管理体系和每月举办经济、财务、利润、现金流量、生产成本、产品质量运行分析会，高新技术和企业管理研讨会，使各环节都能达到高效运转和良性循环。全年实现销售收入100083万元，利税9611万元，利润6327万元。
　　2001年是新世纪的第一年，也是菱花集团应对经济全球化、提高市场竞争力、实现二次创业宏伟目标的关键一年。公司的总体思路是:叫响一个口号 "两手抓、两手硬，一手抓管理、一手抓科技";落实“四本”指导思想，即"务实高效、倒逼成本，科技领先、人才为本，队伍建设、责任为本，深化改草、效益为本";实现 "大提高、大发展、大调整、大联合"的四大战略目标。全年实现销售收入94934万元，利税9619万元，利润5807万元。
　　2004年，公司提出了“创百亿企业，树百年菱花”的二次创业的新思路、新目标，在5－6年内投资50.8亿元，总产出120亿元，新增利税32亿元。总体思路是：“以效益为中心，以市场为导向，以发展为主题，以联合、调整为动力，以科技、人才为根本，在大提高、大发展、大调整、大联合上力求突破”，不断提升企业核心竞争力，再造竞争优势。把菱花集团建设成为高科技、外向型、大而强的世界一流生物企业。通过招商引资、合资合作和拓展国内国际贸易两条线，实现两个轮子一起转。全年实现销售收入120684万元，利税12579万元，利润8088万元。
　　2005年是菱花集团的 "科技年"，其指导思想是 "科技领先、提高发展、深化改革、创新超前"。公司内、外全部实行买卖关系，财务高度集中，强化 "人、财、物"流的管理，全面提高经济运行质量。以全面改制为契机（注：公司于2005年3月28日召开了企业改制的职工代表大会，与会代表一致表决通过了《菱花集团有限公司改制方案》和《菱花集团有限公司资产界定量化方案》。通过体制改革，做到了产权明晰、职责分明、优化结构、机制完善，给公司带来了新的发展动力和活力），实现企业内部管理水平的全面提升，建设 "以人为本"的企业文化，实现利润最大化。
　　2005年，通过全面改制和提速发展，企业的综合实力和核心竞争力大大增强，经济运行质量明显提高，效益指标创历史最好水平。全年实现销售收入148222万元，利税14199万元，利润9064万元。
　　2006年是菱花集团有限公司的“和谐发展、创效”年，公司的工作指导思想是:"科技领先、提高发展、深化改革、创新超前"，内、外全部实行买卖关系，财务高度集中，强化"人、财、物"流的管理，全面提高经济运行质量。继续发扬"艰苦创业、永不满足"的企业精神，坚持"四清、四化、三落实"的原则，坚持"高、低、快、活"的治厂方针，强化"清、勤、严、明"的干部守则和"勤、学、实、干"的职工守则。以全面改制为契机，实现企业内部管理水平的全面提升，建设"以人为本"的企业文化，实现利润的最大化。全年实现销售收入和利税分别比上年同期增长37.02％、34.04％。
　　2007年是菱花集团有限公司的“节约、环保”年，全年的工作指导思想是：“提高效益、科学发展、强化管理、科技领先 ”。公司在抓好整体大平衡、整合好所有资源的前提下，以节约和环保为总突破口，以强化思想建设、打造“以人为本”的企业文化为动力，推动科技的提高、市场的拓展、品牌的提升、成本的降低，实现利润的最大化。
公司将继续发扬“艰苦创业、永不满足”的企业精神，坚持“高、低、快、活”的治厂方针，落实“清、勤、严、明”的干部守则和“勤、学、实、干”的职工守则，按照“四清、四化、三落实”的原则，抓好全年任务目标的分解、落实。全年确保实现利税1.43亿元，争取1.55亿元。
　　2007年元月5日 菱花集团顺利通过省环保局清洁生产审核绩效评估，综合得分95分，为当前全省最高分。
　　2007年元月26日 上午，菱花集团有限公司董事会第一届五次会议在公司三楼会议室胜利召开。
下午，菱花集团有限公司第三次股东会议在公司一楼会议室召开。与会股东对一些涉及公司发展全局的重大议题、原则问题，逐一反复深入全面进行商讨，并形成了共识。
　　2007年元月31日 国家淮河流域水污染防治考评组来公司检查环保治理工作。山东省副省长才利民，省环保局长张波以及省直有关部门领导陪同视察。对各项监测指标表示满意，对公司的污水治理工作给予了较高评价。
　　2007年3月16日 菱花集团有限公司顺利通过食品卫生安全管理体系（HACCP）认证，取得了认证机构第三方认证证书。